Перед началом работы скопируйте файл example-config.yml как config.yml и в нем сконфигурируйте столько экземпляров ShadowSocks сколько вам нужно.
Создайте файл Docker Compose командой
python3 main.py
Первый запуск
docker-compose up -d
Перезагрузка для применения изменений
docker-compose restart
Остановка
docker-compose down